在移动和射击操作方面，《火线指令2》和前作差别不大。射击都是需要一只手来瞄准，另一只手进行射击，虽然玩家可以用双手同时完成瞄准和射击动作，但总感觉变成《僵尸之城2》那般自动射击会更加轻松一些。移动方面，本作仍然无法让角色到处走，只能在固定地几个点移动。通常情况下在战斗中无需移动，但如果发现敌人使用重型武器或者投掷手雷，就必须立即转换阵地。
《火线指令2》的战斗场面非常宏大，从巷战到攻坚战应有尽有，敌人会从各个位置向玩家展开攻击。除了敌人步兵之外，还会有卡车、坦克、直升飞机等拥有重火力的敌人向玩家展开疯狂的进攻。遇到强敌时玩家要小心应对，摸清对方的攻击规律，瞅准时机探出身来反击。任务开始时会公布胜利条件，只要达成任务条件就可以获得胜利。
每次战斗之后，系统都会给玩家一些钞票和金块，钞票可以用来强化自身武器和队友，金块就是用来买先进的武器。面对后期大批大批出现的敌人，手里老捧着Tomahawk可是不行的。另外，也要适量的花一些钞票在队友身上，可别小瞧了这几个兄弟，他们的存在证明了你不是一个人在战斗！
