游戏中的副本其实就是根据三国历史上的各个经典战役制作的，像黄巾之乱、讨伐董卓、官渡之战。每个战役按照进程还划分了若干个小型关卡。在出战前，玩家可以选择简单、普通、困难三种难度，每种难度都有特定的达成条件，完成即可取得一面战旗，比如至少上阵一个蜀将、战斗结束总血量剩余90%等等。通关每个副本后，根据玩家获得的战旗数量，还可以领取包含银币、元宝、道具奖励的金银铜宝箱，是非R玩家的主要收入来源。
卡牌系统
卡牌游戏中获取卡牌的方式无外乎抽卡和副本掉落，《一二三国》也不例外。游戏中的武将按势力分为魏、蜀、吴、群雄，按类型又分为先锋（肉盾型）、猛将（武力型）、谋士（智力型）、策士（辅助型）、医师（治疗型），每个武将都有独特的武将技能。一个完整的队伍至少要包含1张先锋、2到3名猛将或谋士、1到2名策士和医师。
在出战时，如果想要完成不同难度要求的达成条件，还需要根据武将的势力、类型调整出战阵容，这就十分考验玩家的板凳深度了，一套班子不可能通吃所有场合。另外，独特的将缘系统还可以给武将带来额外的属性加成，比如廖化与姜维同时上阵时两人的速度+2%，廖化与关兴同时上阵时两人的攻击+6%等等，搭配不同的将缘武将出战，也别有一番乐趣。
装备系统
《一二三国》的卡牌培养系统加入了很多RPG的元素，除了基本的吞噬升级外，还可以给武将配备武器、坐骑、兵符、兵法、宝物五种装备，大量提高武将的武力、智力、速度、统御。武器、坐骑和兵符还能通过升级来提高武将属性。这里笔者建议优先提升武器和坐骑等级，武力、智力影响伤害值，而速度决定着战斗中的出手顺序，先出手的好处玩家应该都明白。
活动系统
除了常规的副本外，《一二三国》另外设计了活动副本供玩家参加。黄巾追击可以获得兑换兵法必须的兵法徽记；守卫洛阳闯过的关卡越多，则可获得越多的银币，如闯关失败还可以邀请好友协助；在奇遇谷中，玩家通过掷骰子不断前进，随机触发各种事件，有机会获得大量银币、装备和稀有熊猫卡奖励。客观的说，《一二三国》的活动副本算是比较丰富的。